| Título: | Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática |
| Autor(es): | Lopes, Ingrid Santana |
| Orientador(es): | Holanda, Maristela Terto de |
| Assunto: | NoSQL (Not Only SQL)
Banco de dados
Biologia computacional
Big Data |
| Data de apresentação: | 28-Nov-2018 |
| Data de publicação: | 19-Abr-2021 |
| Referência: | LOPES, Ingrid Santana. Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática. 2018. 79 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Engenharia da Computação)—Universidade de Brasília, Brasília, 2018. |
| Resumo: | Para a quantidade crescente de dados gerados por várias áreas do conhecimento dá-se
o nome de Big Data. Neste cenário, pode-se dizer que as pesquisas de bioinformática
necessitam de dados de proveniência, pois estes são capazes de fornecer o histórico das informações coletadas no workflow da pesquisa e responder questões relacionadas à origem
dos dados. Big Data trouxe o surgimento da abordagem NoSQL (Not Only SQL) como
uma alternativa ao uso de Modelos de Banco de Dados Relacional por não apresentar as
limitações observadas no Modelo de Banco de Dados Relacional quando este é aplicado
em uma grande quantidade de dados. Com foco no MongoDB, este trabalho propõe,
com o auxílio de um programa, criado capaz de executar automaticamente um workflow,
armazenar sua proveniência e dados brutos em três diferentes formatos de documentos:
referencial, embutido e híbrido. Essas três maneiras diferentes são comparadas e analisadas usando parâmetros como tempo e recursos de consulta. Os resultados mostraram
algumas particularidades da bioinformática e vantagens ou desvantagens para cada mod-
elo. |
| Abstract: | The increasing amount of data named generated by several areas of knowledge is named
Big Data. In this scenary, it can be said that Bioinformatic researchs needs provenance
data, since it is capable of providing the history of the information collected in the research
workflow and answer questions related to the data source. Big Data brought the emergence of the NoSQL (Not Only SQL) approach as an alternative to the use of Relational
Database Models because it does not present the limitations observed in the Relational
Database Model when it is applied in a large dataset. With focus on MongoDB, this work
proposes a program that can automatically execute a workflow and store its provenance and
raw data into three different document formats: reference, embedded and hybrid. Those
three different ways are compared using parameters such as time and query capabilities.
Results showed some bioinformatics particularities and advantages or disadvantages for
each model. |
| Informações adicionais: | Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2018. |
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| Aparece na Coleção: | Engenharia da Computação
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